В сентябре 2016 года инфекционная заболеваемость выше уровня аналогичного периода прошлого года на 6,8%. Общее число случаев инфекционных заболеваний составило 25808 (1107,10 на 100 тыс. населения).
         Отмечен рост заболеваемости острыми кишечными инфекциями установленной этиологии – на 28,7%, энтеровирусной инфекцией – на 20,9%, хроническими гепатитами В – на 15,4%, и С – на 30,2%, педикулёзом – на 38,1%, инфекционным мононуклеозом – на 51,2%, сифилисом – на 22,1%, внебольничной пневмонией – на 40,8%, микроспорией – на 25,8%.
         Зарегистрированы единичные случаи заболевания лептоспирозом, малярией, аскаридозом, эхинококкозом, по 2 случая – острым вирусным гепатитом Е, менингококковой инфекцией, по 3 случая - острым вирусным гепатитом С, ГЛПС, цитомегаловирусной инфекцией, 4 случая - болезнью Лайма, 6 случаев - скарлатиной, 7 случаев – лихорадкой Западного Нила, 56 случаев - коклюшем. 
         Отмечено снижение заболеваемости сальмонеллезами – на 24,7%, дизентерией – на 42,3%, острыми кишечными инфекциями неустановленной этиологии – на 18,0%, острым вирусным гепатитом А – на 30%, ветряной оспой – на 26,5%, туберкулезом – на 15,4%, гонококковой инфекцией – на 56,4%, чесоткой – на 55,3%, энтеробиозом – на 13,2%.
         На уровне аналогичного периода прошлого года заболеваемость острым вирусным гепатитом В. 
         В сентябре 2016 года в области зарегистрировано 22678 случаев заболевания ОРВИ, и 2 гриппом, что на 7,7% выше аналогичного периода 2015 года. Эпидситуацию по заболеваемости ОРВИ определяли дети до 14 лет (70,1%). Отмечалось превышение недельных эпидемических порогов по совокупному населению по области на 20,5%, в возрасте 0-2 года на 1,0%, 3-6 лет на 10,7%, 7-14 лет на 12,1% и центральному городу субъекта Воронежа по совокупному населению на 11,3%, 0-2 года на 16,3%, 3-6 лет на 18,1%, 7-14 лет на 2,0% на 40 неделе наблюдения (с 26.09.2016г по 02.10.2016г).
         За медицинской помощью по поводу укусов животными обратилось 555 человек (сентябрь 2015г – 634 человека), укусов клещами – 127 (сентябрь 2015г – 93). Зарегистрировано 14 лабораторно подтверждённых случаев заболевания бешенства у животных в Аннинском (1), Бобровском (1), Лискинском (1), Нижнедевицком (2), Острогожском (1), Россошанском (2), Семилукском (1), Таловском (2), Хохольском (1) районах области и г. Воронеж (2). 
          В сентябре 2016 года при проведении эпизоотологического обследования при лабораторном исследовании клещей - у 1 обнаружена ДНК возбудителя инфекционного клещевого боррелиоза (Рамонский район), у 1 - антиген возбудителя туляремии в Богучарском районе.