Одним из направлений деятельности Управления Роспотребнадзора по Воронежской области является осуществление санитарно-карантинного контроля в пунктах пропуска через государственную границу Российской Федерации, который направлен на недопущение завоза и распространения на территории Воронежской области инфекционных болезней, а также на предотвращение ввоза товаров, химических, биологических и радиоактивных веществ, представляющих опасность для населения.
          В Воронежской области действую 3 пункта пропуска через государственную границу Российской Федерации: 1 в городе Воронеж (воздушный пункт пропуска Аэропорт Воронеж (Чертовицкое)) и 2 в Кантемировском районе (многосторонний автомобтльный пункт пропуска «Бугаевка», двухсторонний автомобильный пункт пропуска «Новобелая»).
          За 9 месяцев 2016 года в пунктах пропуска через государственную границу Российской Федерации должностными лицами Управления досмотрено на наличие инфекционных болезней более 204 тысяч человек. По результатам было выявлено 3 человека с признаками инфекционных болезней. Во всех случаях был организован и проведен комплекс противоэпидемических мероприятий.
           Также осуществляется санитарно-карантинный контроль в отношении транспортных средств подконрольных грузов. За 9 месяцев 2016 года досмотрено более 54 тысяч транспортных средств, 41 партий грузов. Временное приостановление транспортных средств не осуществлялось.
          Проведение мероприятий, направленных на недопущение завоза и распространения на территории Российской Федерации опасных инфекционных болезней и грузов, представляющих опасность для человека, находится на постоянном контроле Управления Роспотребнадзора по Воронежской области.